Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL16A1Q07092 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL16A1Q07092 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms