Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms