Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms