Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms