Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms