Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 PAU18YLL064C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 PAU6YNR076W 363 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 PAU20YOL161C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 LCL1YPL056C 306 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 SEC5YDR166C 2916 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 PRP39YML046W 1890 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 HYP2YEL034W 474 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 RPO41YFL036W 4056 nt2.41□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 MBB1YJL199C 327 nt2.4□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YLR140WYLR140W 327 nt2.4□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SWA2YDR320C 2007 nt2.4□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 NIP100YPL174C 2607 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 TCB2YNL087W 3537 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SEC26YDR238C 2922 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 TRS130YMR218C 3309 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 BUB1YGR188C 3066 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 snR74snR74 88 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YOR376WYOR376W 369 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YPR203WYPR203W 309 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YKU70YMR284W 1809 nt2.39□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YRB1YDR002W 606 nt2.38□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YCL046WYCL046W 324 nt2.38□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 PHO2YDL106C 1680 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SMC6YLR383W 3345 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 JSN1YJR091C 3276 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 RPS27BYHR021C 249 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 RPS29AYLR388W 171 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YOR218CYOR218C 420 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 MNE1YOR350C 1992 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 NUP100YKL068W 2880 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 MET18YIL128W 3099 nt2.37□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SPC98YNL126W 2541 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YBL012CYBL012C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SGF11YPL047W 300 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 FAR11YNL127W 2862 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 UBR1YGR184C 5853 nt2.36□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 ESC1YMR219W 4977 nt2.35□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 CLN3YAL040C 1743 nt2.35□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YOR170WYOR170W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 TOP2YNL088W 4287 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 ZRG17YNR039C 1818 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 SRP14YDL092W 441 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 VPS8YAL002W 3825 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.34□□□□□ -2.03
YKR011CQ02209 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.33□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YDR209CYDR209C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YGL217CYGL217C 342 nt2.33□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 FKS3YMR306W 5358 nt2.33□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 IRA2YOL081W 9240 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 TFC8YPL007C 1767 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 SPO75YLL005C 2607 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 ARP8YOR141C 2646 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 MSC6YOR354C 2079 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 PSD2YGR170W 3417 nt2.32□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 PDR1YGL013C 3207 nt2.31□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 MRP10YDL045W-A 288 nt2.31□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.31□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.31□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 RPS17AYML024W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 MCM10YIL150C 1716 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 NOP14YDL148C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 ZIP1YDR285W 2628 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 ISW1YBR245C 3390 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 TUS1YLR425W 3924 nt2.3□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 EDS1YBR033W 2760 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YNL170WYNL170W 396 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 YOR055WYOR055W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 DCP2YNL118C 2913 nt2.29□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 RSE1YML049C 4086 nt2.28□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 RPL34BYIL052C 366 nt2.28□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 snR46snR46 197 nt2.28□□□□□ -2.04
YKR011CQ02209 PUT3YKL015W 2940 nt2.28□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 RLM1YPL089C 2031 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ULI1YFR026C 510 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ECM12YHR021W-A 456 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 SKP2YNL311C 2292 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 UBP15YMR304W 3693 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 KRE33YNL132W 3171 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 SAS3YBL052C 2496 nt2.27□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ELG1YOR144C 2376 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.5 ms