Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms