Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms