Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms