Protein–RNA interactions for Protein: P87012

YCL001W-A, Putative pelota-like protein YCL001W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCL001W-AP87012 PRP16YKR086W 3216 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 LTE1YAL024C 4308 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 snR84snR84 550 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 YDR220CYDR220C 294 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 YBR071WYBR071W 636 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.28□□□□□ -2.36
YCL001W-AP87012 APL2YKL135C 2181 nt0.28□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YDL073WYDL073W 2955 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YMR160WYMR160W 2451 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 BUD26YDR241W 288 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YHR054CYHR054C 1065 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 CMC1YKL137W 336 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 UPS1YLR193C 528 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YLR217WYLR217W 324 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YBL062WYBL062W 381 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YPR099CYPR099C 357 nt0.27□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 PAN2YGL094C 3348 nt0.26□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 RSM27YGR215W 333 nt0.26□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.26□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YPR170CYPR170C 336 nt0.26□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 SPO23YBR250W 1572 nt0.26□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 BI4Q0120 1917 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 MET32YDR253C 576 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 ISD11YER048W-A 285 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 TIM10YHR005C-A 282 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.25□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 BFR2YDR299W 1605 nt0.24□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 INA22YIR024C 651 nt0.24□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YOR218CYOR218C 420 nt0.24□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YPR153WYPR153W 423 nt0.24□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.23□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YGR042WYGR042W 816 nt0.23□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 RPC10YHR143W-A 213 nt0.23□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 HIT1YJR055W 495 nt0.23□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 RRT1YBL048W 312 nt0.23□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 SLI15YBR156C 2097 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 NUP120YKL057C 3114 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 PRE4YFR050C 801 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 GMC2YLR445W 567 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.22□□□□□ -2.37
YCL001W-AP87012 YDR008CYDR008C 351 nt0.21□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 RPS24BYIL069C 408 nt0.21□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 SPC2YML055W 537 nt0.21□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 NPR2YEL062W 1848 nt0.21□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 ALY2YJL084C 3141 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YGL015CYGL015C 393 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 CWC23YGL128C 852 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 RPL26BYGR034W 384 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 ABF2YMR072W 552 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 RPL32YBL092W 393 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YLL032CYLL032C 2478 nt0.2□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 CHS6YJL099W 2241 nt0.19□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 snR5snR5 204 nt0.19□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 NPC2YDL046W 522 nt0.19□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 VAM3YOR106W 852 nt0.19□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YOR282WYOR282W 321 nt0.19□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 SBH1YER087C-B 249 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 RPL9AYGL147C 576 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 PAU12YGR294W 363 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 MRPL31YKL138C 396 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YPR096CYPR096C 303 nt0.18□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 UTP20YBL004W 7482 nt0.17□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.17□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 BEM3YPL115C 3387 nt0.17□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 ULP2YIL031W 3105 nt0.17□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 FMP27YLR454W 7887 nt0.16□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YFR057WYFR057W 456 nt0.16□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YLR271WYLR271W 825 nt0.16□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 COG4YPR105C 2586 nt0.16□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YSP1YHR155W 3687 nt0.15□□□□□ -2.38
YCL001W-AP87012 YDR344CYDR344C 444 nt0.15□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 PMP1YCR024C-A 123 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 GPG1YGL121C 381 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 TAD1YGL243W 1203 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YGR115CYGR115C 780 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 ENV11YGR071C 2583 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 PPN1YDR452W 2025 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.14□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YGR228WYGR228W 345 nt0.13□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.13□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 UBX4YMR067C 1251 nt0.13□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 CDC33YOL139C 642 nt0.13□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 RFX1YLR176C 2436 nt0.13□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 TRS65YGR166W 1683 nt0.12□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YJR003CYJR003C 1560 nt0.12□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 SPO11YHL022C 1197 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YLR252WYLR252W 306 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 RPL26AYLR344W 384 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YOR029WYOR029W 336 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 NOP9YJL010C 2001 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 YCK3YER123W 1575 nt0.11□□□□□ -2.39
YCL001W-AP87012 ZIP2YGL249W 2115 nt0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms