Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX3P78415 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRX3P78415 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms