Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM193AP78312 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms