Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NOMO3P69849 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOMO3P69849 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NOMO3P69849 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOMO3P69849 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOMO3P69849 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NOMO3P69849 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOMO3P69849 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms