Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARF6P62330 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARF6P62330 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARF6P62330 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms