Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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