Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms