Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FAM3BP58499 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3BP58499 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3BP58499 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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