Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP4P57796 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP4P57796 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP4P57796 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP4P57796 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms