Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BACE1P56817 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BACE1P56817 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BACE1P56817 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BACE1P56817 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms