Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFRA1P56159 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms