Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52P55327 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52P55327 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52P55327 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms