Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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