Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCN3P51790 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms