Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA4P51532 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms