Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCNN1GP51170 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCNN1GP51170 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms