Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF6P49848 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF6P49848 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF6P49848 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF6P49848 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms