Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP153P49790 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP153P49790 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP153P49790 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NUP153P49790 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NUP153P49790 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP153P49790 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP153P49790 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP153P49790 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP153P49790 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP153P49790 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms