Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES1P49788 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms