Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN1S1P47710 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms