Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPOP42166 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPOP42166 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPOP42166 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPOP42166 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPOP42166 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms