Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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