Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 PDE2YOR360C 1581 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 MKT1YNL085W 2493 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YDL152WYDL152W 366 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 OCA6YDR067C 675 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YFR057WYFR057W 456 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 APL2YKL135C 2181 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YBR032WYBR032W 303 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YPL197CYPL197C 414 nt0.34□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 URM1YIL008W 300 nt0.33□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 SPC2YML055W 537 nt0.33□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YPR147CYPR147C 915 nt0.33□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 PAN3YKL025C 2040 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YGR042WYGR042W 816 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 PAC1YOR269W 1485 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 DBP6YNR038W 1890 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 PAN2YGL094C 3348 nt0.32□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YIL059CYIL059C 366 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 VAM3YOR106W 852 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YPR096CYPR096C 303 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YPR099CYPR099C 357 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 ALY2YJL084C 3141 nt0.31□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 OST1YJL002C 1431 nt0.3□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YLR271WYLR271W 825 nt0.3□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YMR254CYMR254C 309 nt0.3□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 BFR2YDR299W 1605 nt0.3□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 BI4Q0120 1917 nt0.3□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 MMS4YBR098W 2076 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YMR160WYMR160W 2451 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 TIM10YHR005C-A 282 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 LYS14YDR034C 2373 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 WAR1YML076C 2835 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 ENV11YGR071C 2583 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 LCD1YDR499W 2244 nt0.29□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 SPO23YBR250W 1572 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 ISD11YER048W-A 285 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 PRE4YFR050C 801 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 RSM27YGR215W 333 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 INA22YIR024C 651 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 HIT1YJR055W 495 nt0.28□□□□□ -2.36
YHR140WP38842 MRPL32YCR003W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YGL015CYGL015C 393 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YGR115CYGR115C 780 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YGR228WYGR228W 345 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.27□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YDR008CYDR008C 351 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YDR114CYDR114C 303 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 MET32YDR253C 576 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YJR079WYJR079W 330 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 UPS1YLR193C 528 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 ABF2YMR072W 552 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YOR218CYOR218C 420 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YBR063CYBR063C 1215 nt0.26□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 SLY1YDR189W 2001 nt0.25□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 MRPL31YKL138C 396 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 SDS22YKL193C 1017 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 RRT1YBL048W 312 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 CSM4YPL200W 471 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YBR071WYBR071W 636 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YPR153WYPR153W 423 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 POP7YBR167C 423 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YLL032CYLL032C 2478 nt0.24□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 ESP1YGR098C 4893 nt0.23□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YDR344CYDR344C 444 nt0.23□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 PPN1YDR452W 2025 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YCR100CYCR100C 951 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 YGL230CYGL230C 444 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 RPL26BYGR034W 384 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 RPS24BYIL069C 408 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 RPL32YBL092W 393 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 CHS6YJL099W 2241 nt0.22□□□□□ -2.37
YHR140WP38842 NPC2YDL046W 522 nt0.21□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 snR9snR9 187 nt0.21□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 GMC2YLR445W 567 nt0.21□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.21□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 SLI15YBR156C 2097 nt0.21□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 TAD1YGL243W 1203 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YOR029WYOR029W 336 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YOR282WYOR282W 321 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YCL002CYCL002C 792 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 NPR2YEL062W 1848 nt0.2□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 COG4YPR105C 2586 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 BEM3YPL115C 3387 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 MND1YGL183C 660 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 SCEIQ0160 708 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.19□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 SBH1YER087C-B 249 nt0.18□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.18□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 MRPS8YMR158W 468 nt0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.7 ms