Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGCXP38435 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms