Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARGP37231 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARGP37231 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPARGP37231 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPARGP37231 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms