Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms