Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP1P29466 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms