Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1P29120 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms