Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNCP24821 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNCP24821 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNCP24821 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNCP24821 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNCP24821 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNCP24821 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNCP24821 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNCP24821 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNCP24821 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms