Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms