Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERBB3P21860 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms