Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA4P12838 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms