Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP3P12645 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP3P12645 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP3P12645 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BMP3P12645 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP3P12645 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms