Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAMP11215 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms