Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD28P10747 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD28P10747 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD28P10747 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD28P10747 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD28P10747 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms