Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 NNF2YGR089W 2811 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 RSM18YER050C 417 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 VPS52YDR484W 1926 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 PXA2YKL188C 2562 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 ARV1YLR242C 966 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 MRPL50YNR022C 420 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 YOR199WYOR199W 330 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 PDE2YOR360C 1581 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 VPS74YDR372C 1038 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 ISD11YER048W-A 285 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 RPL29YFR032C-A 180 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 CMS1YLR003C 876 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 MKT1YNL085W 2493 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 snR34snR34 203 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 OCA6YDR067C 675 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 PSF2YJL072C 642 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 YMR324CYMR324C 243 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 REF2YDR195W 1602 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 SDH2YLL041C 801 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 YPL080CYPL080C 327 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 IRC2YDR112W 309 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 RMD6YEL072W 696 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 UPS1YLR193C 528 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 CHS6YJL099W 2241 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 SRP14YDL092W 441 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 ULI1YFR026C 510 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 SPO11YHL022C 1197 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 LOA1YPR139C 903 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 GLG1YKR058W 1851 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-HP0C2J7 SLD3YGL113W 2007 nt0.09□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 MMS4YBR098W 2076 nt0.09□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 ALG13YGL047W 609 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YGR042WYGR042W 816 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 GPX1YKL026C 504 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 snR44snR44 211 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 snR59snR59 78 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 RUB1YDR139C 234 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 ATP20YPR020W 348 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 LCD1YDR499W 2244 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 ZIP1YDR285W 2628 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 MLP1YKR095W 5628 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 AFR1YDR085C 1863 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YDL152WYDL152W 366 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 RPL26BYGR034W 384 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 RRT1YBL048W 312 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 DAD1YDR016C 285 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 DFG10YIL049W 762 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YOP1YPR028W 543 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YPR099CYPR099C 357 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 VIK1YPL253C 1944 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 SPO23YBR250W 1572 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 KAR1YNL188W 1302 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 LSO2YGR169C-A 279 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 RPL37AYLR185W 267 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 ATG16YMR159C 453 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-HP0C2J7 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YBR184WYBR184W 1572 nt0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 snR79snR79 84 nt0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 PET111YMR257C 2403 nt0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 PMP1YCR024C-A 123 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 GPG1YGL121C 381 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 COX3Q0275 810 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 ENV11YGR071C 2583 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 BIG1YHR101C 1008 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 SBH1YER087C-B 249 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 LIN1YHR156C 1023 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 HAL9YOL089C 3093 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 RSM27YGR215W 333 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 NOP9YJL010C 2001 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 VMA21YGR105W 234 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 RPS7BYNL096C 573 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 RPL32YBL092W 393 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 MYO1YHR023W 5787 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 snR84snR84 550 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YDR008CYDR008C 351 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 GIM5YML094W 492 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 BI4Q0120 1917 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-HP0C2J7 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 PRP21YJL203W 843 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 COX7YMR256C 183 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-HP0C2J7 IRC13YOR235W 315 nt-0.03□□□□□ -2.42
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