Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRCP08575 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRCP08575 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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