Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG5P05408 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCG5P05408 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCG5P05408 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCG5P05408 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCG5P05408 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCG5P05408 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms