Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGAP02671 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGAP02671 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGAP02671 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGAP02671 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGAP02671 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGAP02671 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGAP02671 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGAP02671 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGAP02671 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGAP02671 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGAP02671 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGAP02671 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FGAP02671 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms