Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD4O95243 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD4O95243 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms