Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms